在中国历史上，元朝的建立标志着蒙古帝国对中国的征服，也是中亚地区政治格局的一个重大转变。然而，这一时期并非没有问题和矛盾。到了明朝初年，当朱元璋篡夺了元朝的政权时，他面临着如何处理这段复杂历史遗留的问题。
首先，需要理解的是，在元末民变期间，红巾军起义背后隐藏着深刻的社会矛盾和经济危机。这场大规模动荡不仅摧毁了当时的中央集权政府，还给整个社会带来了巨大的破坏。因此，当朱元璋最终统一了天下，并确立了明朝，他必须考虑到如何恢复国家秩序，以及如何解决由此产生的一系列问题。
其次，对于朱元璋来说，从一个农民起家的将领到成为帝王，无疑是一个巨大的跃升。在这个过程中，他必然会从不同的角度去审视前任政府，即使是在同为汉人统治下的北宋、南宋与辽金也存在一定差异。特别是在与蒙古人的交往中，由于文化、语言等多种因素，一些制度可能已经发生变化或被淘汰。而且由于战争年代造成的人口流离失所以及经济萎缩，使得原有的税收体系难以为继，因此新的税制也需要调整。
再者，从政治学角度来看，每个新兴政权都希望通过改革来巩固自己的地位，而这种改革往往意味着打破旧有的体制结构，以适应新的情况。在这样的背景下，明太祖推行了一系列改革措施，其中包括废除或者修改一些来自于蒙古帝国（即 元朝）的一些政策和制度，如户籍管理系统、土地所有制等，以便更好地调动资源和人口，将注意力集中在重建国家基础上。
最后，在文化传承方面，由于长期战乱导致文人士绅大量死亡，同时各地书院遭受严重破坏，因此清理残余敌对势力同时也是为了恢复正规教育体系，为培养新一代人才奠定基础。此外，因为宗教信仰在当时具有很高的地位，所以对于佛教、道教及伊斯兰教等宗教进行一定程度上的包容与整合，不仅有助于稳定地方秩序，也有利于融入其他民族群体，是明初维护国家统一稳定的重要手段之一。
总而言之，当明太祖篡夺汗位之后废除部分元朝遗留下的政权结构，是基于他对自身历史环境、国内外形势以及个人野心的一系列考量。他采取这些措施是为了重新塑造国家机构，更好地应对内忧外患，为开创一个更加繁荣昌盛的时代打下坚实基础。
