政治腐败的蔓延
元朝初期，忽必烈在位期间实行了一系列改革，如废除科举、推行新货币等，以巩固中央集权。然而随着时间的推移，政治体系逐渐变成了一个由宦官和外戚控制的专制体制。宦官们通过贿赂和结党营私，掌握了大量权力，并且他们之间互相牵连，不断地侵占国家财政，导致国家财政状况日益恶化。这一现象不仅影响到了地方政府，还直接削弱了中央对地方的控制能力。
内部矛盾激化与民族问题
元朝是蒙古帝国在中国大陆建立的一个多民族国家。在统一后，一些少数民族如汉族、回族、藏族等开始反抗蒙古统治，他们认为自己被压迫，被排斥，没有得到应有的尊重和待遇。而一些原先忠于元朝的少数民族，如西北地区的一些突厥人，也因为受到汉人的排挤而转向抵抗。此外，由于种种原因，比如文化差异、语言隔阂以及历史上的冲突，这些内部矛盾很难得到妥善解决，最终演变成不可调和的冲突。
农业生产衰退与自然灾害频发
农业是当时社会经济生活中最重要的一部分，但元末时期由于土地开垦过度，加之气候变化和自然灾害频发，使得粮食产量下降。长期以来不断发生的大旱、小麦减产，以及洪水造成的人口流离失所，都严重影响了民众的生计，使得许多农民无法获得稳定的收入，从而导致社会动荡不安。同时，由于战争损耗，大量人口死亡或流离失所，加剧了劳动力的短缺，对农业生产造成进一步打击。
经济危机与通货膨胀
随着战乱不断，各地城市破坏殆尽，大量商品停运，而金属钱币却依旧大量发行以满足战争需求。这导致纸币迅速贬值，因为金银价格上涨超过了其面值，因此人们更愿意持有真金白银而非纸币。此外，由于税收制度弊端明显，当时政府为了填补空洞的手段，便采取增加税收来弥补亏空，这也加剧了人民负担，使得经济形势更加严峻。
外患威胁与边疆防御失败
从红巾军起义到朱棣篡位，每一次内乱都给予敌人机会，让边疆防御变得越来越脆弱。在这些混乱的情况下，不仅游牧部落接连入侵，而且甚至有南宋残余势力试图复辟，再次挑战元朝统治。当时正规军队疲惫不堪，又或者分散兵力去镇压国内叛乱，所以根本没有足够力量去有效防御来自四方的威胁。这样一系列因素交织在一起，最终使得元朝面临前所未有的多方面挑战，其结果只能是覆亡。
