自幼随祖父居住在京城,少年朱耐根对皮黄腔有着浓厚的兴趣,他得到了谭鑫培传授的真传。之后,朱耐根以票友的身份,在上海、杭州、汉口和常州等地都曾进行过义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名,被誉为“南朱北王”。著名的票友陈小田在他的书《京剧音韵概论》中提到谭派中的杰出人物,朱耐根就是其中之一。苏少卿在其文章《剧评》中赞扬了朱氏的声音,“如浮云遮月”,声调优美,如同小余一样,但他自己的声音区别于众,又显得更加纯熟。
随着年龄的增长,朱耐根选择以票友的身份定居上海。在那里,他被尊称为“耐二爷”,并被视作票界的一位宗师。朱氏精通谭派唱腔,并且曾经在扬州和常州教授这些技艺。他结拜了宝应一带很多知名票友,如佑申和郭季良,他们经常与他切磋技艺,从而受益匪浅。后来,在宝应地区学习京剧的人数众多,这也正是因为受到朱氏影响。而他的夫人魏雅兰,也是一位资深的票友。
三张由高亭公司灌制的声音资料,是非常珍贵的地方文献,它们记录了《法场换子》、《梅龙镇》(这次合作的是他夫人魏雅兰)以及《探母回令》(这次合作的是陈小田)。由于谭鑫培没有录制过这样的唱片,这些声音资料成为了研究谭派声乐艺术不可多得的资源(现在这几张唱片可以找到是在上海图书馆)。