清明时分，西湖岸边花红柳绿，断桥上面游人如梭，真是好一幅春光明媚的美丽画面。突然，从西湖底悄悄升上来两个如花似玉的姑娘，怎么回事？人怎么会从水里升出来呢？原来，她们是两条成了人形的蛇精，虽然如此，但她们并无害人之心，只因羡慕世间的多彩人生，才一个化名叫白素贞，一个化名叫小青，都想体验一次人类的情感和生活。偏偏老天爷忽然发起脾气来，霎时间下起了倾盆大雨，使得白素贞和小青被淋得无处藏身，就在这紧要关头，一位温文尔雅、白净秀气的年轻书生撑着伞为她们遮雨。两人见到他的善举，不禁都红了脸相互产生了爱慕之情。
那位书生自称许仙，他住在断桥边，小青主动打招呼并且向他介绍自己与白素贞。此后，他们三个人常常相聚，而白素贞与许仙之间的情愫日益加深，最终他们结婚，并开了一家“保和堂”药店，在那里他们用自己的智慧治愈了许多病痛，并且帮助穷苦的人民不收取任何费用，这让人们更加喜欢他们。
然而，这段幸福生活激怒了金山寺的一位法海和尚，因为“保和堂”的兴旺及众人的信仰转移，让他的寺庙香火大减。他阴险地发现白素贞其实是一条变成人的蛇精之后，便开始策划分裂夫妇、毁掉药店的手段。他诬陷许仙说：“你的妻子其实是个危险人物，她可能会伤害你。”但许仙不相信这些谣言，因为他知道自己的妻子心地善良，而且她已经怀孕，他怎能离开她呢？
法海愤怒于未能达到目的，将许仙囚禁起来。而此时，“保和堂”中担忧已久的小青得知丈夫被捕后，与白娘子一起前去求救。在法海拒绝放行的情况下，小青决定使用她的力量，用金钗引发洪水直冲金山寺。这场风暴虽然给法海带来了巨大的困扰，但最终还是被他以长堤抵御而平息。由于这个原因，以及考虑到怀孕的小肚皮，更是无法再战，再次遭受压迫，小青不得不屈服于法海。
数十年后，小青经过长期修炼终于重获自由，对抗恶势力，最终将法海逼入螃蟹腹中，从雷峰塔下解脱出来的正是她。她与许仙以及他们的孩子重新团聚，无论未来发生什么，他们都不曾再度分离。
