察合台汗国的创立者孛儿只斤·察合台是成吉思汗的次子，他在1211年随父征伐金朝，与术赤、窝阔台一起攻掠云内、东胜、武、朔诸州。1213年，再次大举分道伐金，破太行山东西两侧大部州县。1219年随成吉思汗西征，参与进攻花剌子模，并受封畏兀儿以西直至阿姆河之间的草原地区。
1225年成吉思汗出征西夏，察合台留守蒙古大斡耳朵，与长兄术赤不和，但与弟窝阔台相处较融洽。在成吉思汗逝世后，察合台遵照遗命拥戴窝阔台即位，并亲执臣属之礼，维护大汗尊严。他熟悉札撒（法令），执法严峻，对于窝阔台极尊重，在重要事务上必先咨商其意见。
1241年5月，察合台病逝前夕，即由他的继承人也速蒙哥嗣为可汗。察合台创建了名义上的元朝西北宗藩国——察合台汗国，其疆域东至吐鲁番、罗卜泊，西及阿母河，北到塔尔巴哈 台山，南越兴都库什山。
在政权中，他不仅统治了成吉思汗给予的兀鲁思和军队，而且在别失八里自己的王国中也享有至高的权力。据拉施特《史集》记载，大汉经常派去使者就一切重大事件和他商议，没有他的意见和同意就不处理这些大事。
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