政治腐败和中央集权过度
元朝自成吉思汗建立以来，实行严格的中央集权制度。随着时间的推移，这种制度逐渐演变为官僚主义和专制主义。蒙古贵族之间的权力斗争、宦官干政以及皇帝对外扩张战争耗费巨大的人力物力，使得国家财政日益紧张，行政效率降低。在这种背景下，一些地方军阀开始独立自主，不再完全听从中央指挥，最终导致了国家内部矛盾激化。
经济疲弊与社会动荡
元朝在征服中取得了辉煌，但这也带来了极大的经济负担。长期的战争破坏了原有的生产体系，农田荒废，大量人口死亡或流离失所。而且由于金币贬值严重，加之对外贸易减少，国库空虚。此外，由于连年战乱，社会秩序混乱，加上瘟疫流行等自然灾害频发，这些都加速了元代经济危机的发展。
文化交流断裂与民族分裂
元代曾经是东西方文化交流的大通道，但随着时间的推移，这种文化交流逐渐断裂。大批汉人知识分子被迫改宗或者逃往南宋，而元政府又采取了一系列排斥汉人的政策，如限制学术研究、压制儒家思想等。这不仅影响到了文化传承，也加剧了民族矛盾，使得原来的统一帝国变得多民族并存。
外患不断与边疆防御困难
元朝在东北边疆一直面临着女真部落（即后来建立明朝的地主阶级）的威胁。这些部落通过联结和攻占一些孤立无援的小型城镇，以最小损失换取最大收益，从而逐步壮大自己的力量，并最终形成强大的政治实体——建州土酋势力。此外，在西北地区，与察合台汗国之间不断发生冲突也是元朝面临的一个重要问题。
农民起义爆发及其深远影响
1351年至1368年的红巾军起义是中国历史上规模最大的一次农民起义。这场起义最初由朱元璋领导，其核心诉求是反抗封建剥削和压迫，同时也包含了一定的救赎意识，即希望能获得天命以平天下。但这个运动最终导致朱元璋篡夺皇位成立明王朝，对中国近千年的政治格局产生深远影响，并标志着元朝走向灭亡的一个重要转折点。
