自幼随祖父居住在京城,朱耐根对皮黄腔有着深厚的热爱,他曾经得到了谭鑫培亲传的真传。后来,朱耐根以票友的身份,在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名,有“南朱北王”的美称。在谭派艺术界的人物中,朱耐根被陈小田先生所著《京剧音韵概论》一书中提及,并列为其中的一位知名人物。苏少卿先生在《剧评》上赞誉他的声腔“如浮云遮月”,其传唱之风格不仅媲美小余,还更显苍劲有力,是真正炉火纯青。
随着年岁的增长,朱耐根以票友的身份定居于上海,那里的人们尊称他为“耐二爷”,并视他为票界中的宗师。他的唱腔专长于谭派,这一流派对他来说就像第二天性。他曾在扬州和常州教授这门艺术,使其影响遍及那里的每一个角落。在宝应地区,有些票友如佑申和郭季良与他结拜,他们经常切磋技艺,从而受益匪浅。这也正是为什么后来宝应地区学者对于京剧产生了极大的兴趣,因为他们受到过朱氏教导。甚至连他的夫人魏雅兰,也是一位擅长京剧表演的票友。
关于他的唱片,由高亭和百代两家公司灌制了三张,其中包括《法场换子》、《梅龙镇》(合作演出)以及《探母回令》(与陈小田合作)。由于这些唱片是基于谭鑫培没有留下的原版,因此它们成为了研究谭派声音艺术的一个宝贵资料(现存上海图书馆)。