经济衰败与民族矛盾激化
元朝的经济在征服蒙古、汉族地区后，面临着巨大的挑战。首先，由于长期的战争消耗和对外扩张，国家财政陷入困境。同时，为了维持统治和满足军事需求，元朝大量发行纸币导致货币贬值，引起了商业活动的停滞。这不仅影响了生产，也加剧了社会贫富差距，使得中下层民众日益失望。
此外，由于元朝采用了一种将蒙古人、高级官员、汉族士绅等多民族群体混合起来统治的政策，这种多民族共存状态并未能解决根本问题，而是使得不同民族之间产生深刻的民族矛盾。例如，在政治上，以蒙古人为主导的一方与汉族士绅形成对立；在经济上，一些地方实行“分田制”限制农民自由耕作，加剧了农民阶层的不满。而这些矛盾最终演变成爆发内乱甚至反叛，是推动元朝灭亡的一个重要因素。
农业灾害与自然环境变化
随着时间推移，气候条件发生变化，大量农业灾害如旱灾、洪水等频繁发生，对当时农业社会来说，这无疑是一个致命打击。在一些重灾区，如南京一带，因连年干旱造成粮食产量的大幅减少，不仅造成饥荒，而且还促使百姓流离失所，从而进一步削弱了中央集权政府对全局控制能力。
此外，即便是在没有大规模自然灾害的情况下，由于气候变暖和土壤退化等原因，使得土地肥力不断下降，再加上人口压力过大，无力适应这种情况的小农户们也难以生存，这些因素共同作用下，最终导致整个农业生产体系崩溃，为 元代灭亡埋下伏笔。
政治腐败与军事疲惫
由于长期以来由忽必烈及其他皇帝采取的一系列措施——包括开疆拓土、奖励功臣以及广泛使用非正规部队——导致政治系统内部出现严重的问题。一方面是宦官专权和高级官员腐败现象普遍存在，他们通过私吏、私党来操控市场，从而牟取暴利；另一方面，是军事力量因为长期用兵而疲惫不堪，以及缺乏有效管理和训练制度，使得边防巡逻效率低下，加强内部安全保护成为泡影。
此外，在忽必烈晚年，他试图改革选举制度，但这项改革未能持续下去，并且遭到许多既有势力的抵抗，最终无法彻底改变旧有的政治结构。此类事件反映出一个不断增长但又无法得到有效管理的手工业劳动者群体，以及城市商人阶层日益增强其经济地位，但却被排斥于政治决策之外的心理紧张关系，这些都是推动元代走向末路不可逆转趋势之一环扣上的链条。
