政治腐败与中央集权的倒退
在明朝初期，朱元璋即位后实行严格的中央集权制度，建立起了以皇帝为中心的官僚体系。然而随着时间的推移，这种制度逐渐演变成了一种极端中央集权，导致地方行政效率大降。官员之间相互勾结、贪污腐败现象日益严重，加上选举官员方式单一，使得人才选拔不公正，从而形成了一个体制内的小圈子。这直接影响到了国家政务运行效率和政策决策质量。
军事上的失败与边疆防御危机
明朝军事上的主要问题是缺乏有效的现代化建设。在农业社会转型过程中，军队并未跟上时代步伐，依旧保持着传统的手持武器和战术。而且，由于对新兴手枪等火器技术认识不足，对外战争时常处于劣势。同时，因为边疆广阔，不易统一管理加之财政拮据，再加上蒙古等民族不断侵扰，使得边疆防御长期处于紧张状态。
经济发展停滞与人民生活困难
尽管明初经济发展有所进步，但由于过度征税、土地兼并以及银本位货币制度造成的大量流通金属短缺等原因，最终导致经济增长放缓。人口也因为饥荒、疾病和战争而减少，而政府因财政困难无法提供足够的人力资源来改善民生状况，因此民众普遍生活贫困。
文化教育上的落后与封建思想固化
虽然明朝文化艺术取得了一定的成就，如文学家如徐渭、冯梦龙等人的出现，以及戏曲《南柯记》、《西厢记》的创作，但整体来说文化教育水平较低，大多数人接受的是儒家经典教育，而科学技术知识则很少得到普及。此外，由于政治压迫和思想审查，一些新的学术观点无法在社会上得到传播，这使得整个社会进入一种思想闭塞状态。
社会矛盾激化与反抗运动频发
随着社会矛盾的积累，不满情绪日益浓厚。不仅如此，一些农民起义如李自成领导下的农民起义，也表达了对封建专制制度深刻不满。但这些反抗运动往往因为内部纷争或是遭受镇压而最终失败，从未能真正改变中国历史走向。
