自幼随祖父居住在京城，少年朱耐根对皮黄腔的热爱让他得以拜谭鑫培为师，领悟到传统的艺术精髓。在成年之后，他不仅是一名票友，还曾在上海、杭州、汉口和常州等地免费表演，为观众带来京剧的魅力。与王君直齐名，他们共同被誉为“南朱北王”，是京剧界的一颗璀璨星辰。谭派的代表人物之一，在苏少卿所著《剧评》中，对他的声腔赞誉有加：“如浮云遮月”，其音色犹如小余，但更加具有苍劲之气，是一位炉火纯青的艺人。
中年后，朱耐根选择了上海作为他的归宿，在这里，他以票友身份深受人们尊敬，被称作“耐二爷”并被奉为票界中的宗师。他擅长于谭派唱腔，并且在扬州和常州等地传授自己的技艺，与宝应地区的票友们结下了深厚的情谊。他们包括居佑申、郭季良等，这些人都曾与朱氏切磋技艺，从而受益匪浅。甚至到了宝应，那里的研究者对于京剧也有着浓厚兴趣，这无疑是受到朱氏影响的一个体现。此外，朱耐根夫人魏雅兰也是一个票友，她与丈夫共同推动着这门艺术文化向前发展。
他的唱腔作品通过高亭和百代两家公司灌制成了三张珍贵的唱片，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（合作演出）和《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些唱片没有谭鑫培本人的录音，它们成为研究谭派声腔艺术不可多得的资料资源（现在已存放在上海图书馆），对于理解这一时代及更早期的声音风格至关重要。
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